Umweltfaktor

Die National Institutes of Health (NIH) verfügen über eine neue Richtlinie zur Datenverwaltung und -freigabe, die alle vom NIH finanzierten Forscher dazu verpflichtet, einen NIH-Plan zur Datenverwaltung und -freigabe (DMS) zu erstellen, umzusetzen und zu melden. Die neue Richtlinie, die am 25. Januar in Kraft trat, soll sicherstellen, dass vom Steuerzahler finanzierte Forschung öffentlich zugänglich gemacht wird. Der DMS-Plan umfasst sechs Elemente, die dazu beitragen werden, staatliche Forschungsdaten in Richtung der FAIR-Prinzipien (Findable, Accessible, Interoperable und Reusable) zu bewegen.

Um Forscher in den Umweltgesundheitswissenschaften bei ihrem neuen Auftrag zu unterstützen, veranstaltete die NIEHS Environmental Health Language Collaborative (EHLC) drei halbtägige Workshops mit dem Titel „Teilen Sie Ihre Daten aus den Umweltgesundheitswissenschaften: Metadaten, Standards und Tools“.

„Der Zweck der Workshops bestand darin, das Bewusstsein für Metadaten, Standards und Tools zu schärfen und deren Nutzung zu fördern, die Forscher zur Einhaltung der neuen Richtlinie 2023 nutzen können“, sagte Stephanie Holmgren, Programmmanagerin im NIEHS Office of Data Science und Vorsitzende von der Planungsausschuss für das Workshop-Programm. „Die Workshops waren für alle gedacht, die den NIH-Datenverwaltungs- und -austauschplan entwickeln oder umsetzen oder daran interessiert sind, Möglichkeiten zur effektiven Verwaltung, Weitergabe und Wiederverwendung von Daten aus den Umweltgesundheitswissenschaften zu erlernen.“

Im Einklang mit der Mission von EHLC lag der Schwerpunkt der Workshop-Reihe darauf, Forschern in den Umweltgesundheitswissenschaften dabei zu helfen, die Elemente eins (Datenbeschreibungen) und drei (Standards) der sechs erforderlichen Richtlinienelemente einzuhalten, die in einen DMS-Plan aufgenommen werden müssen. Die Präsentationen befassten sich mit Werkzeugen für die Annotation von Metadaten und enthielten Informationen darüber, wie Ontologien und kontrollierte Vokabulare gefunden und verwendet werden können, die für die Forschung in den Umweltgesundheitswissenschaften relevant sind.

Der Zweck des ersten Elements im DMS-Plan besteht darin, detaillierte Beschreibungen und Namenskonventionen anzuwenden, die das Auffinden von Daten erleichtern. Insbesondere wird die Einbeziehung von Metadatendetails erwartet. Metadaten sind Daten, die zusätzliche Informationen liefern, um wissenschaftliche Daten interpretierbar und nachnutzbar zu machen.

Beispielsweise werden alle Daten in Repositories gespeichert und standardisierte Beschreibungen helfen bei Anmerkungen, Suchfunktionen und Informationsextraktion. Durch diese einheitliche Terminologie können Studiendaten wiederverwendet und interoperabel gemacht werden.

„Metadaten sind äußerst wichtig, weil sie dabei helfen zu kommunizieren, wie die Daten generiert wurden und worum es in den Daten geht“, sagte Holmgren. „Dann kann nicht nur ein anderer Mensch diese Daten verstehen, sondern auch Maschinen können diese Daten verstehen. Mit der Maschinenleistung können wir viel mehr aus den Daten machen, indem wir Rückschlüsse auf die Daten ziehen oder Muster in den Daten erkennen, wodurch Forscher komplexere Fragen angehen können.“

Zusätzlich zu klaren Beschreibungen ist auch die Notwendigkeit einer Community-Entwicklung, eines Konsenses und der Annahme von Standards für die Strukturierung von Daten aus den Umweltgesundheitswissenschaften erforderlich.

„Um die Daten FAIR zu machen, braucht man wirklich gute Metadaten, und diese guten Metadaten entstehen, wenn man von der Community unterstützte Metadatenstandards hat“, sagte Mark Musen, MD, Ph.D., von der Stanford University, während einer Workshop-Präsentation .

In der Reihe wurden grundlegende Standards hervorgehoben, die für die Umweltgesundheitswissenschaften relevant sind, und detaillierte Best Practices für das Vorgehen, wenn für bestimmte Aspekte einer Forschungsstudie keine Standards existieren.

„Wir sind uns bewusst, dass jede Studie einzigartig ist und ihre eigenen Aspekte haben wird, aber es gibt immer noch einen grundlegenden gemeinsamen Nenner für die Natur einer Studie zur Reproduktionstoxikologie oder einer Studie zur Umweltepidemiologie“, sagte Holmgren.

Die Umsetzung des DMS-Plans umfasst die gemeinsame Nutzung von Daten.

„Es reicht nicht mehr aus zu sagen: ‚Daten werden auf Anfrage weitergegeben.‘ Jetzt besteht die Anforderung, die Daten tatsächlich in ein Repository einzureichen“, sagte Holmgren.

Zu den Best Practices für die Repository-Freigabe gehören die folgenden.

„Im Kern der neuen Richtlinie geht es wirklich darum, den Wert zu vermitteln, warum der Datenaustausch wichtig ist“, sagte Holmgren. „Wenn Sie Daten ordnungsgemäß teilen möchten, müssen Sie Ihre Daten effektiv verwalten. Die beiden sind eng miteinander verbunden, da die Datenverwaltung während des gesamten Forschungslebenszyklus erfolgt. Der DMS-Plan hilft Forschern, vor der Durchführung einer Studie über Fragen der Datenverwaltung und des Datenaustauschs nachzudenken.“

Zu den weiteren NIEHS-Mitgliedern des Programmplanungsausschusses gehörten Chris Duncan, Ph.D., Jennifer Fostel, Ph.D., Richard Kwok, Ph.D., Anna Maria Masci, Ph.D., Charles Schmitt, Ph.D., und Vickie Walker.

(Jennifer Harker, Ph.D., ist technische Redakteurin im NIEHS Office of Communications and Public Liaison.)